Для каких задач это нужно
Проработка архитектуры оправдана, если проект затрагивает несколько систем одновременно (1С плюс сайт плюс внешние сервисы), меняет структуру данных, от которой зависит множество отчётов и печатных форм, или рассчитан на рост — расширение будет дорабатываться в несколько этапов, а не сдаётся один раз и забывается.
Чем это отличается от обычной доработки
Обычная доработка сразу пишет код под конкретную задачу. Проработка архитектуры — отдельный этап до кода: как устроено решение, какие модули за что отвечают, как обеспечивается совместимость с будущими обновлениями конфигурации и обновлениями платформы 1С. Итог — техническое решение, по которому можно оценить трудозатраты точнее, чем на глаз, и которое проще передать другому специалисту, если потребуется.
Когда можно обойтись без этого этапа
Для точечных доработок — новый отчёт, доработка одной печатной формы, небольшая автоматизация — отдельная проработка архитектуры обычно избыточна: достаточно обсуждения задачи и почасовой оценки. Разница в масштабе: если ошибка в решении затронет одну доработку — риск невелик, если несколько систем сразу — стоит спроектировать заранее.